¿Es lo mismo formatear una PC de escritorio a una Notebook?

Básicamente SI.

Si tenemos un SO operativo como Windows y queremos tenerlo en una Notebook se puede poner, se adapta bien al funcionamiento de una Notebook, quizás el único inconveniente sean los drivers. A veces instalarlos se complica, pero una vez que lo tenemos podemos hacer una copia de nuestros drivers y llevarlo a un pendrive. Recomiendo http://www.drivermax.com/. Es un software gratuito que te permite hacer un backup de los drivers y portarlo en tu pendrive. Una vez que formateás la PC o Notebook importamos los drivers y listo!